Собрание Национального музея древнего искусства включает несколько тысяч экспонатов, которые условно подразделяются на художественные и декоративно-прикладные коллекции. Экспозиция начинается с картин всемирно известных мастеров живописи XIV-XIX веков. На первом этаже музея можно увидеть полотна Рафаэля, Иеронима Босха, Альбрехта Дюрера, Антонио ван Дейка, Диего Веласкеса, Лукаса Кранаха, Ганса Гольбейна, Яна Брейгеля Младшего. Самым известным шедевром, представленным здесь, является картина Босха «Искушение святого Антония». Здесь также демонстрируются предметы европейского декоративно-прикладного искусства и антикварная мебель.
На втором этаже располагается коллекция восточного и африканского искусства, здесь наибольший интерес вызывают китайская керамика и ювелирные украшения. Третий этаж отведен под произведения португальских художников. Национальный музей древнего искусства находится в здании, построенном в XVII веке, частью его экспозиции является капелла Альберта.