Музей "Афросиаб" расположен недалеко от одноименного городища. В коллекции этого учреждения представлено свыше 22 тысяч экспонатов, найденных при раскопках данной археологической зоны. Самые древние из них датируются еще периодом завоеваний Александра Македонского, также хорошо освещены и более поздние исторические эпохи.
В музее "Афросиаб" можно увидеть скелеты древних людей, фрагменты оссуариев (сосудов для хранения человеческих останков), фрагменты зданий и городской канализации средневекового Самарканда, а также уникальные фрески Самаркандского дворца, на которых изображены сцены правления династии Ишхидов. Самые ценные образцы настенной живописи датируются VII-VIII веками. Наряду с архитектурными памятниками в экспозиции представлены орудия труда, керамика, терракотовые статуэтки, пейзажные барельефы, монеты, ювелирные украшения, холодное оружие. Особый интерес вызывают деревянные скульптуры, частично сохранившиеся после пожара, погубившего Афросиаб.