Экспозиция, освещающая историю органического мира, геологию планеты Земля, воздействие человека на окружающую среду. Смысловым центром Музея естественной истории в Зальцбурге выступают 36 аквариумов, в которых представлены обитатели Средиземного моря, Амазонки и местных водоемов. Их дополняют 56 террариумов, в которых можно увидеть ядовитых змей со всего мира, черепах, ящериц, аллигаторов, лягушек. В Зале Космических исследований демонстрируется диорама высадки человека на Луну, модели ракет, детальный макет орбитальной станции.
Специальные интерактивные экспонаты знакомят посетителей с новыми технологиями, особенностями человеческой анатомии, законами физики, эпохами в истории Земли (например, Ледниковым периодом). Кроме того, в Музее естественной истории в Зальцбурге можно увидеть различные скелеты и чучела животных, образцы полезных ископаемых, здесь работает биологическая лаборатория, проводятся тематические выставки. К услугам посетителей работает ресторан.