Старейшая среди сохранившихся романских церквей Лиона. Построена в концe XI – начале XII века, хотя некоторые детали ее интерьера датируются еще античной эпохой. Церковь Сен-Мартен д'Эне была возведена на том месте, где захоронили тела лионских мучеников, в том числе и святую Бландину. Сейчас ее именем названа одна из крипт базилики.
Внешний облик храма довольно строгий, его стены украшают лишь немногочисленные мозаики. Снаружи выделяется только колокольня с узкими окнами и четырьмя полупирамидами по углам крыши. Внутри церкви Сен-Мартен д'Эне привлекают внимание массивные колонны, взятые еще из древнеримского храма, и алтарные росписи, выполненные учеником знаменитого Энгра Ипполитом Фландреном. Росписи изображают святых покровителей Франции и Лиона: Иисуса Христа, Деву Марию, архангела Михаила, святого Мартина, первого лионского епископа святого Потина, святых Бландину и Клотильду. В разное время эту церковь посещали Папы Римские и французские короли.