Археологический музей Ханьи располагается в здании бывшей францисканской церкви XVI века, успевшей также побывать и мечетью во времена османского владычества.
В его коллекции представлены предметы различных исторических эпох, начиная от минойской и римской и заканчивая венецианской. На витринах демонстрируются фрагменты древних зданий, глиняные таблички, напольные мозаики.
Собрание предметов древних культур в Археологическом музее Ханьи довольно разнообразное. Здесь можно увидеть минойский саркофаг, несколько римских бюстов, ритуальные сосуды и статуэтки, модель минойского корабля, золотые украшения. Особенно богата коллекция старинных монет. После осмотра экспозиции посетители могут отдохнуть в небольшом внутреннем дворике.