Византийский музей Ханьи расположился в помещении бывшей церкви Сан Сальваторе на берегу Венецианской гавани. Храм возведен в XV веке монахами-францисканцами.
Основу музейной коллекции составляют произведения религиозного искусства Византийской империи: иконы, фрагменты фресок и напольных мозаик, статуи, ювелирные украшения и церковная утварь. Ряд икон в отличном состоянии даже сохранили первозданный цвет, поэтому представляют не только историческую, но и художественную ценность.
Помимо этих экспонатов в Византийском музее Ханьи можно увидеть предметы, относящиеся к более поздним периодам процветания христианства на острове. В частности, здесь представлена коллекция венецианских монет.